공간 전사체학 기반 리보핵단백질 복합체(RNP)의 세포 소기관 특이적 분포 분석 방법론

공간 전사체학은 특정 세포 내 위치에 존재하는 mRNA 및 기타 전사 후 RNA를 높은 공간 해상도로 매핑하는 기술이며, 이는 리보핵단백질 (RNP) 복합체의 세포 소기관 내 분포를 이해하는 데 필수적입니다.

분석 기법의 핵심

• In Situ Hybridization (ISH) 기반 검증: 타겟 RNP 구성 요소와 관련된 특정 RNA 서열에 대한 고해상도 FISH(Fluorescence In Situ Hybridization) 프로토콜을 적용하여 초기 위치 정보를 확보합니다.
• 공간 분해 시퀀싱 (Spatial Sequencing): 캡쳐된 세포 영역으로부터 직접 RNA 정보를 추출하여, 해당 지역의 전사체 프로파일과 RNP 관련 분자의 밀도를 동시에 측정합니다.

이를 통해 특정 RNP 복합체가 미토콘드리아, ER, 혹은 핵 내 어떤 소기관에 집중되어 있는지 확인하며, 이는 전사 후 조절 메커니즘의 공간적 맥락을 제공합니다. 주요 분석 단계에는 Signal Integration 및 Deconvolution 과정이 포함됩니다.